MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Brevundimonas subvibrioides ATCC 15264 chromosome

Total Repeats: 81360

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014375	G	6	6	275	280	0 %	0 %	100 %	0 %	302381117
2	NC_014375	CGA	3	9	292	300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302381117
3	NC_014375	GCC	2	6	481	486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302381117
4	NC_014375	GAAC	2	8	488	495	50 %	0 %	25 %	25 %	302381117
5	NC_014375	TCC	2	6	555	560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302381117
6	NC_014375	GTC	2	6	596	601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302381117
7	NC_014375	CGA	2	6	628	633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302381117
8	NC_014375	CG	3	6	657	662	0 %	0 %	50 %	50 %	302381117
9	NC_014375	CGC	2	6	668	673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302381117
10	NC_014375	TCG	2	6	706	711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302381117
11	NC_014375	TCT	3	9	787	795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302381117
12	NC_014375	CTG	2	6	825	830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302381117
13	NC_014375	GGT	2	6	875	880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302381117
14	NC_014375	CCG	2	6	889	894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302381117
15	NC_014375	CCG	2	6	940	945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302381117
16	NC_014375	TGC	3	9	976	984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302381117
17	NC_014375	GAT	2	6	987	992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302381117
18	NC_014375	TCG	2	6	1000	1005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302381117
19	NC_014375	CCG	2	6	1095	1100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302381117
20	NC_014375	GGC	2	6	1142	1147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302381117
21	NC_014375	CGCT	2	8	1179	1186	0 %	25 %	25 %	50 %	302381117
22	NC_014375	CGC	2	6	1214	1219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302381117
23	NC_014375	GGC	2	6	1331	1336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302381117
24	NC_014375	CGA	2	6	1370	1375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302381117
25	NC_014375	CTG	2	6	1386	1391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302381117
26	NC_014375	GCG	2	6	1405	1410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302381117
27	NC_014375	AGA	2	6	1444	1449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302381117
28	NC_014375	AGCG	2	8	1491	1498	25 %	0 %	50 %	25 %	302381117
29	NC_014375	CGCC	2	8	1514	1521	0 %	0 %	25 %	75 %	302381117
30	NC_014375	AGC	2	6	1549	1554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302381117
31	NC_014375	CGC	2	6	1584	1589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302381117
32	NC_014375	CGG	2	6	1592	1597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302381117
33	NC_014375	ACCAC	2	10	1603	1612	40 %	0 %	0 %	60 %	302381117
34	NC_014375	GAC	2	6	1656	1661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302381117
35	NC_014375	TGC	2	6	1952	1957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302381118
36	NC_014375	CGG	2	6	1961	1966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302381118
37	NC_014375	CGC	2	6	1986	1991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302381118
38	NC_014375	CCGCCC	2	12	2057	2068	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	302381118
39	NC_014375	CGA	2	6	2133	2138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302381118
40	NC_014375	CGG	2	6	2192	2197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302381118
41	NC_014375	CGAC	2	8	2216	2223	25 %	0 %	25 %	50 %	302381118
42	NC_014375	GC	4	8	2231	2238	0 %	0 %	50 %	50 %	302381118
43	NC_014375	TGA	2	6	2246	2251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302381118
44	NC_014375	GAG	2	6	2302	2307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302381118
45	NC_014375	CTA	2	6	2313	2318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302381118
46	NC_014375	GGC	2	6	2353	2358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302381118
47	NC_014375	CTG	2	6	2365	2370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302381118
48	NC_014375	CGAC	2	8	2381	2388	25 %	0 %	25 %	50 %	302381118
49	NC_014375	CCTGGC	2	12	2397	2408	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	302381118
50	NC_014375	CGCCCG	2	12	2414	2425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302381118
51	NC_014375	GCC	2	6	2431	2436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302381118
52	NC_014375	CCG	2	6	2481	2486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302381118
53	NC_014375	CTG	2	6	2488	2493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302381118
54	NC_014375	GAC	2	6	2494	2499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302381118
55	NC_014375	CCA	2	6	2684	2689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302381118
56	NC_014375	CGGT	2	8	2707	2714	0 %	25 %	50 %	25 %	302381118
57	NC_014375	GGCC	2	8	2766	2773	0 %	0 %	50 %	50 %	302381118
58	NC_014375	GGA	2	6	2781	2786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302381118
59	NC_014375	CTG	2	6	2842	2847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302381118
60	NC_014375	GC	3	6	2996	3001	0 %	0 %	50 %	50 %	302381119
61	NC_014375	CG	3	6	3002	3007	0 %	0 %	50 %	50 %	302381119
62	NC_014375	CGG	3	9	3054	3062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302381119
63	NC_014375	GCT	2	6	3073	3078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302381119
64	NC_014375	GCC	2	6	3096	3101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302381119
65	NC_014375	GTT	2	6	3113	3118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302381119
66	NC_014375	GCG	2	6	3134	3139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302381119
67	NC_014375	GCG	2	6	3209	3214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302381119
68	NC_014375	GGGCC	2	10	3227	3236	0 %	0 %	60 %	40 %	302381119
69	NC_014375	GGC	2	6	3240	3245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302381119
70	NC_014375	CGGCG	2	10	3265	3274	0 %	0 %	60 %	40 %	302381119
71	NC_014375	CGG	2	6	3278	3283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302381119
72	NC_014375	CGG	2	6	3297	3302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302381119
73	NC_014375	CGT	2	6	3323	3328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302381119
74	NC_014375	CGGGA	2	10	3329	3338	20 %	0 %	60 %	20 %	302381119
75	NC_014375	GCC	2	6	3354	3359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302381119
76	NC_014375	GAC	2	6	3394	3399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302381119
77	NC_014375	GGGC	2	8	3400	3407	0 %	0 %	75 %	25 %	302381119
78	NC_014375	CCT	2	6	3412	3417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302381119
79	NC_014375	CGG	2	6	3433	3438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302381119
80	NC_014375	GCA	2	6	3481	3486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302381119
81	NC_014375	GGC	2	6	3498	3503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302381119
82	NC_014375	GCGG	2	8	3504	3511	0 %	0 %	75 %	25 %	302381119
83	NC_014375	GCG	2	6	3517	3522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302381119
84	NC_014375	CCAG	2	8	3526	3533	25 %	0 %	25 %	50 %	302381119
85	NC_014375	CGC	3	9	3547	3555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302381119
86	NC_014375	CCA	2	6	3565	3570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302381119
87	NC_014375	CG	3	6	3647	3652	0 %	0 %	50 %	50 %	302381119
88	NC_014375	CGC	3	9	3682	3690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302381119
89	NC_014375	CGGTC	2	10	3694	3703	0 %	20 %	40 %	40 %	302381119
90	NC_014375	GAAGGC	2	12	3746	3757	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	302381119
91	NC_014375	CGC	2	6	3769	3774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302381119
92	NC_014375	CG	4	8	3815	3822	0 %	0 %	50 %	50 %	302381119
93	NC_014375	CCG	2	6	3894	3899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302381119
94	NC_014375	ATC	2	6	3915	3920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302381119
95	NC_014375	GCC	3	9	3921	3929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302381119
96	NC_014375	CCCTGA	2	12	4106	4117	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	302381120
97	NC_014375	GCC	3	9	4135	4143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302381120
98	NC_014375	GTG	2	6	4168	4173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	302381120
99	NC_014375	GGGC	2	8	4190	4197	0 %	0 %	75 %	25 %	302381120
100	NC_014375	CTG	2	6	4207	4212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302381120
101	NC_014375	GC	3	6	4248	4253	0 %	0 %	50 %	50 %	302381120
102	NC_014375	GCC	2	6	4274	4279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302381120
103	NC_014375	G	6	6	4297	4302	0 %	0 %	100 %	0 %	302381120
104	NC_014375	CGA	2	6	4344	4349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302381120
105	NC_014375	CGCGGG	2	12	4377	4388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302381120
106	NC_014375	CGG	2	6	4390	4395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302381120
107	NC_014375	GCT	2	6	4434	4439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302381120
108	NC_014375	CG	3	6	4494	4499	0 %	0 %	50 %	50 %	302381120
109	NC_014375	TTC	2	6	4516	4521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302381120
110	NC_014375	CGC	2	6	4536	4541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302381120
111	NC_014375	GCG	3	9	4555	4563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302381120
112	NC_014375	GCGA	2	8	4589	4596	25 %	0 %	50 %	25 %	302381120
113	NC_014375	GCT	2	6	4602	4607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302381120
114	NC_014375	GC	3	6	4682	4687	0 %	0 %	50 %	50 %	302381120
115	NC_014375	GGC	2	6	4689	4694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302381120
116	NC_014375	TGC	2	6	4721	4726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302381120
117	NC_014375	CG	3	6	4740	4745	0 %	0 %	50 %	50 %	302381120
118	NC_014375	CGG	3	9	4799	4807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302381120
119	NC_014375	CGC	2	6	4833	4838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302381120
120	NC_014375	CGCGGG	2	12	4865	4876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302381120
121	NC_014375	GCC	2	6	4882	4887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302381120
122	NC_014375	CCGCA	2	10	4906	4915	20 %	0 %	20 %	60 %	302381120
123	NC_014375	GAA	2	6	4941	4946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302381120
124	NC_014375	GCC	2	6	4954	4959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302381120
125	NC_014375	GGC	2	6	5018	5023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302381120
126	NC_014375	CGGG	2	8	5033	5040	0 %	0 %	75 %	25 %	302381120
127	NC_014375	CGCC	2	8	5045	5052	0 %	0 %	25 %	75 %	302381120
128	NC_014375	TGC	3	9	5060	5068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302381120
129	NC_014375	CGA	2	6	5118	5123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302381120
130	NC_014375	GGC	2	6	5196	5201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302381120
131	NC_014375	GGGCG	2	10	5217	5226	0 %	0 %	80 %	20 %	302381120
132	NC_014375	GCC	2	6	5530	5535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302381121
133	NC_014375	CAG	2	6	5581	5586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302381121
134	NC_014375	GGC	3	9	5587	5595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302381121
135	NC_014375	CTG	2	6	5614	5619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302381121
136	NC_014375	GCC	2	6	5648	5653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302381121
137	NC_014375	CGA	2	6	5763	5768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302381121
138	NC_014375	GGTCG	2	10	5818	5827	0 %	20 %	60 %	20 %	302381121
139	NC_014375	GAA	2	6	5848	5853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302381121
140	NC_014375	GCAGCG	2	12	5874	5885	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	302381121
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142	NC_014375	GCG	2	6	5910	5915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302381121
143	NC_014375	GTA	2	6	5971	5976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302381121
144	NC_014375	CG	3	6	6030	6035	0 %	0 %	50 %	50 %	302381121
145	NC_014375	CGCC	2	8	6077	6084	0 %	0 %	25 %	75 %	302381121
146	NC_014375	CAGGGC	2	12	6142	6153	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	302381121
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148	NC_014375	GCA	2	6	6195	6200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302381121
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155	NC_014375	CAG	2	6	6370	6375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302381121
156	NC_014375	AGC	2	6	6386	6391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302381121
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160	NC_014375	GACC	2	8	6483	6490	25 %	0 %	25 %	50 %	302381121
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164	NC_014375	CGA	2	6	6588	6593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302381121
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168	NC_014375	CGA	2	6	7010	7015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302381122
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176	NC_014375	CCG	3	9	7312	7320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302381122
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250	NC_014375	CCA	2	6	10283	10288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302381123
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253	NC_014375	TCG	2	6	10396	10401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302381123
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259	NC_014375	GCC	2	6	10789	10794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302381124
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261	NC_014375	CGG	2	6	10843	10848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302381124
262	NC_014375	CGT	2	6	10857	10862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302381124
263	NC_014375	GCCG	2	8	10914	10921	0 %	0 %	50 %	50 %	302381124
264	NC_014375	CGT	2	6	10935	10940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302381124
265	NC_014375	GGC	2	6	11056	11061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302381124
266	NC_014375	CCGC	2	8	11081	11088	0 %	0 %	25 %	75 %	302381124
267	NC_014375	GCG	2	6	11089	11094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302381124
268	NC_014375	CCG	2	6	11124	11129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302381124
269	NC_014375	GC	3	6	11172	11177	0 %	0 %	50 %	50 %	302381124
270	NC_014375	CGA	2	6	11190	11195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302381124
271	NC_014375	CCGG	2	8	11280	11287	0 %	0 %	50 %	50 %	302381124
272	NC_014375	CAG	2	6	11398	11403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302381124
273	NC_014375	GCC	2	6	11413	11418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302381124
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278	NC_014375	CGG	2	6	11698	11703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302381125
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280	NC_014375	GCG	2	6	11817	11822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302381125
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283	NC_014375	GCC	2	6	11948	11953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302381125
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285	NC_014375	GCC	2	6	12014	12019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302381125
286	NC_014375	ACG	2	6	12039	12044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302381125
287	NC_014375	ACCCTG	2	12	12068	12079	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	302381125
288	NC_014375	CGG	2	6	12102	12107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302381125
289	NC_014375	CTG	2	6	12113	12118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302381125
290	NC_014375	GACGA	2	10	12143	12152	40 %	0 %	40 %	20 %	302381125
291	NC_014375	TGC	2	6	12213	12218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302381125
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293	NC_014375	G	6	6	12231	12236	0 %	0 %	100 %	0 %	302381125
294	NC_014375	CGG	2	6	12238	12243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302381125
295	NC_014375	GCG	3	9	12249	12257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302381125
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297	NC_014375	GCC	2	6	12299	12304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302381125
298	NC_014375	GATC	2	8	12331	12338	25 %	25 %	25 %	25 %	302381125
299	NC_014375	CGC	2	6	12384	12389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302381125
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376	NC_014375	CCGG	2	8	15150	15157	0 %	0 %	50 %	50 %	302381128
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380	NC_014375	GA	3	6	15250	15255	50 %	0 %	50 %	0 %	302381128
381	NC_014375	GGGGAA	2	12	15273	15284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	302381128
382	NC_014375	GAC	2	6	15596	15601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302381129
383	NC_014375	AC	3	6	15600	15605	50 %	0 %	0 %	50 %	302381129
384	NC_014375	GGC	2	6	15676	15681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	302381129
385	NC_014375	GCC	2	6	15713	15718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302381129
386	NC_014375	TGC	2	6	15753	15758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302381129
387	NC_014375	CCGGCT	2	12	15798	15809	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	302381129
388	NC_014375	TCC	2	6	15851	15856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302381129
389	NC_014375	TGA	2	6	15867	15872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302381129
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496	NC_014375	CGAT	2	8	20132	20139	25 %	25 %	25 %	25 %	302381132
497	NC_014375	CCA	2	6	20144	20149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302381132
498	NC_014375	GGCC	2	8	20184	20191	0 %	0 %	50 %	50 %	302381132
499	NC_014375	CG	3	6	20213	20218	0 %	0 %	50 %	50 %	302381132
500	NC_014375	CTG	2	6	20233	20238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302381132

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